Introduction à l’analyse bio-informatique des séquences (OBI3)

Présentiel

Domaine : Sciences du vivant - Thématique : Outils informatiques pour l’analyse de données biologiques

L’analyse des séquences des macromolécules est un des aspects fondamentaux de la génomique actuelle. Ce stage permet de s’y former d’un point de vue théorique et pratique.

Public et pré-requis

Public : Biologistes (au sens large), techniciens, techniciennes, chercheurs, chercheuses ingénieurs, ingénieures.

Pré-requis :

Connaissances de base en biologie moléculaire. Habitude du travail sur ordinateur et de l’utilisation d’Internet.

Programme

Alignements 2 à 2 (NWS, Smith&Waterman).
Alignement globaux, alignements par blocs.
Scores d’alignements.
Validation statistique.
Banque de données.
Algorithmes de recherche de similarités dans les banques (algorithmes de FASTA, BLAST, SSEARCH).
Détermination des motifs – recherche de motifs sur les séquences ou sur les banques – Application à la localisation de zones codantes.

Objectifs & Compétences

Le stagiaire comprendra les méthodes et les algorithmes utilisés en génomique et en analyse de séquences.
Il se familiarisera avec l’utilisation des outils bioinformatiques disponibles en ligne.
L’accent sera mis sur l’utilisation raisonnée des logiciels afin d’amener le stagiaire à avoir une analyse critique des résultats.

Les + de la formation

Formation conçue en cohérence avec les besoins identifiés sur le marché du travail
Méthode pédagogique orientée vers l’acquisition d’outils stratégiques et opérationnels efficaces, complets, pertinents et innovants
Corps professoral composé d’enseignants-chercheurs et auteurs de renommée internationale

Pédagogie

Méthodes

Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants (maximum 14 personnes au total).
Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.

Documents : Supports de cours PDF

Modalités d’évaluation

Certificat de réalisation

Et après ?

Cette formation permet aux participants de sécuriser leur parcours professionnel en leur donnant les compétences nécessaires pour accompagner les entreprises dans les enjeux liés à leur secteur d’activité et s’adapter aux évolutions technologiques associées.