Génomique des Populations (analyse de données populationnelles) – OBI6

La formation a pour but de donner les bases nécessaires (concepts et outils informatiques associés) à l’analyse des polymorphismes moléculaires : données de séquences, polymorphismes (SNP et microsatellites) à l’échelle intraspécifique. Les analyses réalisées ont pour objectif d’inférer les processus évolutifs : histoire démographique des populations, flux de gènes, recherches de la trace de sélection dans les génomes.

Le contenu de la formation présente de manière théorique l’effet des forces fondamentales de la micro-évolution (dérive génétique, mutation, sélection et migration) sur les polymorphismes moléculaires. Des travaux pratiques réalisées sur des jeux de données réels analysés à l’aide de logiciels standards viennent appuyer la partie théorique. Ces TP permettent de discuter des résultats obtenus et des scénarios évolutifs inférés.