Biosciences
Maître de Conférence en Bio-Informatique à Sorbonne Université – Faculté des Sciences et Ingénierie
Institut de Génomique Fonctionnelle UMR 5242 – ENS Lyon
https://igfl.ens-lyon.fr/equipes/b.-charrier-morphogenese-des-algues-brunes
Missions
Activités de Formation
Co-responsable de stages courts de Formation Continue
▪ UNIX/LINUX : informatique pour la biologie
▪ Algorithmique et programmation: notion de base pour les biologistes
▪ Introduction à l’analyse bioinformatique des séquences
▪ Phylogénie moléculaire
▪ Conception d’une base de données relationnelle appliquée à la biologie
▪ Génomique des Populations (analyse de données populationnelles).
Diplômes Nationaux / Responsable d’Unités d’Enseignement
◦ Niveau Licence :
▪ Bio-Informatique, les outils indispensables
▪ Bio-Informatique : Algorithmique et Programmation Avancée
◦ Niveau Master : Conception, Représentation, Analyse et Programmation à Objets
Types d’interventions : Cours Magistraux, Travaux Dirigés, Travaux Pratiques en Informatique et Bio-Informatique…
Activité de recherche
Thématique : Modélisation et simulation numérique de la morphogenèse des algues brunes
Publications récentes (cf https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0002-5140-8087) :
◦ S. Boscq, B. Billoud, I. Theodorou, T. Joemmanbaeks, T. Dufourt, B. Charrier (2024) MUM, a maternal unknown message, inhibits early establishment of the medio-lateral axis in the embryo of the kelp Saccharina latissima. Development; dev.202732. https://doi.org/10.1242/dev.202732
◦ S. Boscq, B. Billoud, B. Charrier (2024). Cell-autonomous and non-cell-autonomous mechanisms concomitantly regulate the early developmental pattern in the kelp Saccharina latissima embryo. Plants 13, 1341. https://doi.org/10.3390/plants13101341
◦ I. Boutet, H.J. Alves Monteiro, L. Baudry, T. Takeuchi, E. Bonnivard, B. Billoud, S. Farhat, R. Gonzales-Araya, B. Salaun, A.C. Andersen, J.Y. Toullec, F.H. Lallier, J.F. Flot, N. Guiglielmoni, X. Guo, C. Li, B. Allam, E. Pales-Espinosa, J. Hemmer-Hansen, P. Moreau, M. Marbouty, R. Koszul, A. Tanguy (2022). Chromosomal assembly of the flat oyster (Ostrea edulis L.) genome as a new genetic resource for aquaculture. Evolutionary Applications 15, 1730–1748. https://doi.org/10.1111/eva.13462
