Biosciences

– Professeur des Universités – Sorbonne Université , Institut de Biologie Paris Seine
– Equipe 8, contrôle phénotypique des cellules musculaires lisses
– Adaptation biologique and vieillissement
Sorbonne Université
– CNRS UMR 8256 
– Responsable du parcours physiologie, métabolisme et physiopathologies humaines et directrice des études du Master de Biologie Intégrative et Physiologie.

Biographie

Formation 
1994: Doctorat en Biochimie- physiologie U-Paris VI; 2003: HDR U-Paris VI.
Publications : 39 (Limon I and Limon-Boulez I).

Autres depuis 2007 :

Coordinatrice de 6 programmes financés dont 1 ANR blanche (VRAC8) et un en cours (Fédération Française de Cardiologie).

Encadrement de 4 post-Doc, 8 thèses dont une en cours 2012-2014,

Membre élu de la section 24 du CNRS (2012-2014).

Thème de recherche actuel :

Etude des dynamiques du signal AMPc dans la cellule musculaire lisse pathologique.

Références

Dernières publications

• Blirando K., Blaise R., Gorodnaya N, Rouxel C., Meilhac O., Vincent P. and Limon I. (2015). IL-1β-trans- differentiation of vascular smooth muscle cell towards an inflammatory status is dependent on cAMP/PKA pathway. Biochim Biophys Acta.,1853:3235.
• Verginelli F., Adesso L., Limon I., Alisi A., Gueguen M., Panera N., Giorda E., Raimondi L. Ciarapica R. Campese A.F., Screpanti I. Stifani S., Miele L., Rota R., and Locatelli F. (2015). Activation of an endothelial Notch1- Jagged1 circuit induces VCAM1 expression, an effect amplified by interleukin-1. Oncotarget. 6: 432. [IF : 6.6].
• Hur J., Blaise R., Limon I. (2016). Protocol for isolating mouse cercle of Willis Vis. Exp. 116. doi: 10.3791/54352.

Professeur des Universités en Biologie des Systèmes à Sorbonne Université

Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB – UMR 7205)

Responsable de l’Equipe ‘Adaptation, Intégration, Réticulation, Evolution’

Site Web : https://evol-net.fr/ – https://fc-sorbonne-universite.fr

Missions

Responsabilité de master

• Responsable de la 1ère année de Master de la spécialité BIM (Bioinformatique et Modélisation), mention Biologie Moléculaire et Cellulaire, Master Sciences et Technologies, Sorbonne Université.

Responsable de stages formation continue

• Initiation à la Phylogénie Moléculaire – Formation Continue Sorbonne Université (sorbonne-universite.fr) – OBI4
• Bases Algorithmiques et Statistiques de l’Analyse des Séquences – Applications avec les logiciels disponibles en ligne – Formation Continue Sorbonne Université (sorbonne-universite.fr) – OBI3
• Introduction à la programmation et à l’algorithmique pour les biologistes – Formation Continue Sorbonne Université (sorbonne-universite.fr) -OBI2
• UNIX/LINUX : Informatique pour la biologie – Formation Continue Sorbonne Université (sorbonne-universite.fr) – OBI1
• Conception d’une base de données relationnelle appliquée à la biologie – Formation Continue Sorbonne Université (sorbonne-universite.fr) – OBI5

Activité de recherche

• Thématique : Décrire, structurer et expliquer les processus combinatoires et leurs conséquences en évolution moléculaire et génomique, par des méthodes computationnelles, notamment de réseaux.

• Publications – Profil Google Scholar : http://scholar.google.fr/citations?user=UVCppEoAAAAJ

Responsabilités collectives et administratives à Sorbonne Université (SU)

• Membre du conseil d’Unité de l’UMR 7205 (YSIEB)
• Responsable de la division Bio-Maths-Info-Stats de l’UFR 927 « Sciences de la Vie » – SU
• Membre du réseau Biologie des Systèmes de SU
• Membre du jury de l’école doctorale 515 « Complexité du vivant » SU
• Membre des comités de sélection/commissions de spécialistes section 65 SU

Mots clés : Biologie des Systèmes – Evolution moléculaire et génomique- Bioinformatique – Microbiologie environnementale – Métagénomique comparative – Réseaux et théorie des graphes – Transfert latéral de gènes – Symbiose – Eucaryogenèse – Phylogénétique/phylogénomique – Biologie évolutive du vieillissement

Responsable pédagogique de la LICENCE Langues étrangères appliquées de la Faculté des Lettres de Sorbonne Université.

Missions

Le Pr Jean-Pierre Lotz est professeur de cancérologie à la Faculté de Santé Sorbonne Université et Praticien Hospitalier, chef du service d’oncologie médicale et de thérapie cellulaire à l’hôpital Tenon.

Références

1. Gestational trophoblastic neoplasia after human chorionic gonadotropin normalization in a retrospective cohort of 7761 patients in France.
   Descargues P, Hajri T, Massardier J, Lotz JP, Devouassoux-Shisheboran M, Allias Montmayeur F, You B, Golfier F, Bolze PA. Am J Obstet Gynecol. 2021 Oct;225(4):401.e1-401.e9. doi: 10.1016/j.ajog.2021.05.006. Epub 2021 May 18. PMID: 34019886
2. High-dose Chemotherapy in Germ Cell Cancer Patients With Brain Metastases: Experience of an Expert Center.
   Delaye M, Benderra MA, Deforceville L, Larghero J, Parquet N, Culine S, Grazziotin-Soares D, Lotz JP. Am J Clin Oncol. 2021 Aug 1;44(8):423-428. doi: 10.1097/COC.0000000000000836. PMID: 34081032
3. Patients on oral anticancer drugs and coordinated pathway: CHIMORAL, feedback from care providers.
   Maritaz C, Napoly L, Burnel S, Lotz JP.Bull Cancer. 2020 Dec;107(12):1210-1220. doi: 10.1016/j.bulcan.2020.08.014. Epub 2020 Oct 21. PMID: 33097210 French.
4. Severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2 infection in cancer population: Are patient-related symptoms helpful to track a harmful invisible?
   Assoun S, Benderra MA, Lotz JP, Richard S, Gligorov J. Int J Cancer. 2020 Dec 15;147(12):3576-3578. doi: 10.1002/ijc.33167. Epub 2020 Jul 14. PMID: 32574373 Free PMC article. No abstract available.
5. Utility of a mainstreamed genetic testing pathway in breast and ovarian cancer patients during the COVID-19 pandemic.
   Benusiglio PR, Korenbaum C, Vibert R, Ezenfis J, Geoffron S, Paul C, Richard S, Byrde V, Lejeune M, Guillerm E, Basset N, Lotz JP, Chabbert-Buffet N, Gligorov J, Coulet F. Eur J Med Genet. 2020 Dec;63(12):104098. doi: 10.1016/j.ejmg.2020.104098. Epub 2020 Nov 10. PMID: 33186762 Free PMC article.

Vanda Luengo est professeure d’informatique à Sorbonne Université. Elle est responsable de l’équipe MOCAH du LIP6 et directrice adjointe du laboratoire LIP6 de Sorbonne Université.

Ses recherches portent sur la conception de logiciels dédiés à l’apprentissage humain. Elle s’intéresse plus précisément aux méthodes, modèles et algorithmes d’intelligence artificielle qui permettent une adaptation dynamique selon le modèle de l’apprenant. Pour cela, Vanda Luengo cherche à modéliser d’une part les comportements de l’apprenant qu’elle étudie grâce à des analyses automatiques afin de mieux diagnostiquer et interpréter les erreurs, d’autre part la méthode d’adaptation (le type d’exercices, de retours immédiats ou différées, etc.), et enfin les connaissances liées au domaine d’apprentissage.

Vanda Luengo porte également un programme d’accélération collaborative d’IA en éducation au sein de SCAI qui associe plusieurs équipes de recherche et des entreprises EDTECH.

Elle a une centaine des publications dans les conférences du domaine (Artificial Intelligence In education, European conférence in Technology Enhanced Learning, Learning Analitics and knowledge, Intelligent, Tutoring systems, Environnements informatiques pour l’apprentissage Humain,..).

MISSIONS

– Directrice adjointe du LIP6

– Responsable de l’équipe de Recherche MOCAH du LIP6

– Co responsable du master EDTECH

– Responsable groupe de travail Learning analytics GTNumLA, Numéri’Lab  Direction du Numérique pour l’Education – Évaluatrices des projets dans le domaine EDTECH au niveau national et international

Références

• • I. Nikolayeva, A. Yessad, B. Laforge, V. Luengo : « Does an e-mail reminder intervention with learning analytics reduce procrastination in a blended university course? », 15^th European Conference on Technology-Enhanced Learning, Heidelberg, Germany (2020)
  • M. Guinebert, A. Yessad, M. Muratet, V. Luengo : « Automatic Detection of Peer Interactions in Multi-player Learning Games », European Conference on Technology Enhanced Learning 2019, Delft, Netherlands (2019)
  • F. Harrak, F. Bouchet, V. Luengo, R. Bachelet : « Automatic Identification of Questions in MOOC Forums and Association with Self-Regulated Learning », Proc. of the 12^th International Conference on Educational Data Mining, Montréal, Canada, pp. 564-567 (2019)
  • F. Harrak, F. Bouchet, V. Luengo, P. Gillois : « Profiling Students from Their Questions in a Blended Learning Environment », LAK ’18 Proceedings of the 8^th International Conference on Learning Analytics and Knowledge, Sydney, Australia, pp. 102-110, (ACM) (2018)
  • A. Lebis, M. Lefevre, V. Luengo, N. Guin : « Capitalisation of Analysis Processes : Enabling Reproducibility, Openess and Adaptability thanks to Narration », Proceedings of the 8^th International Conference on Learning Analytics and Knowledge, Sydney, Australia, pp. 245-254, (ACM) (2018)
  • Y. Bourrier, J. Francis, C. Garbay, V. Luengo : « A multi-layered architecture for analysis of non-technical-skills in critical situations », Artificial Intelligence In Education, AIED 2017.

Missions

Le Dr Emmanuelle Magny est Praticien Hospitalière dans le département de Gériatrie de l’hôpital de la Pitié-Salpêtrière. Elle est actuellement Responsable de l’Unité Fonctionnelle Filières ville-hôpital-urgences et responsable de l’équipe mobile intra et extra hospitalière. Ses thématiques d’intérêt sont le parcours patient et le lien ville-hôpital.

Références

1. Torres C, Langlois M, Verny M, Boddaert J, Magny E.
   Organisation et filières gériatriques en réponse aux besoins des SAU [Geriatric pathways and organisation in response to the needs of EDS]. Soins Gerontol. 2021 Sep-Oct;26(151):10-13. French. doi: 10.1016/j.sger.2021.06.003. Epub 2021 Jun 23. PMID: 34462105.
2. Potier L, Magny E, Zerah L, Cohen-Bittan J, Verny M, Boddaert J, Baqué M.
   Approche pragmatique du risque iatrogène aux urgences [A pragmatic approach to iatrogenic risk in the emergency room]. Soins Gerontol. 2021 Sep-Oct;26(151):14-18. French. doi: 10.1016/j.sger.2021.06.004. Epub 2021 Jun 23. PMID: 34462106.
3. Magny E, Donadio C, Maronnat F, Nghiem D, Berthelot E, Belmin J, Lafuente-Lafuente C.
   Hypotensions du sujet âgé : aspects cliniques et thérapeutiques [Hypotensions in the elderly: Clinical and therapeutic features]. Presse Med. 2019 Feb;48(2):134-142. French. doi: 10.1016/j.lpm.2018.11.008. Epub 2019 Feb 3. PMID: 30728099.
4. Magny E, Le Petitcorps H, Pociumban M, Bouksani-Kacher Z, Pautas É, Belmin J, Bastuji-Garin S, Lafuente-Lafuente C.
   Predisposing and precipitating factors for delirium in community-dwelling older adults admitted to hospital with this condition: A prospective case series. PLoS One. 2018 Feb 23;13(2):e0193034. doi: 10.1371/journal.pone.0193034. PMID: 29474380; PMCID: PMC5825033.
5. Magny E, Sagot C, Cohen-Bittan J, Makdessi S, Bertrand A, Verny M, Boddaert J.
   Probable Creutzfeldt-Jakob Disease Mimicking a Perioperative Stroke in an Elderly Adult. J Am Geriatr Soc. 2015 Jun;63(6):1268-9. doi: 10.1111/jgs.13452. PMID: 26096412.

Missions

Philippe Maingon est Professeur des Universités en Oncologie Radiothérapie à la faculté de Santé de Sorbonne Université et Praticien Hospitalier dans le service du GHU La Pitié-Salpêtrière à Paris. Il a consacré sa recherche au développement des nouvelles techniques en radiothérapie. Il a participé à de nombreux travaux dans des groupes coopérateurs nationaux et internationaux pour optimiser la définition des volumes cibles dans différentes pathologies tumorales. Il est membre du Radiation Oncology Safety and Quality Committee de l’ESTRO.

Références

1. Grégoire V, Evans M, Le QT, Bourhis J, Budach V, Chen A, Eisbruch A, Feng M, Giralt J, Gupta T, Hamoir M, Helito JK, Hu C, Hunter K, Johansen J, Kaanders J, Laskar SG, Lee A, Maingon P, Mäkitie A, Micciche’ F, Nicolai P, O’Sullivan B, Poitevin A, Porceddu S, Składowski K, Tribius S, Waldron J, Wee J, Yao M, Yom SS, Zimmermann F, Grau C.
   Delineation of the primary tumour Clinical Target Volumes (CTV-P) in laryngeal, hypopharyngeal, oropharyngeal and oral cavity squamous cell carcinoma: AIRO, CACA, DAHANCA, EORTC, GEORCC, GORTEC, HKNPCSG, HNCIG, IAG-KHT, LPRHHT, NCIC CTG, NCRI, NRG Oncology, PHNS, SBRT, SOMERA, SRO, SSHNO, TROG consensus guidelines. Radiother Oncol. 2018 Jan;126(1):3-24.
2. Valentini V, Gambacorta MA, Barbaro B, Chiloiro G, Coco C, Das P, Fanfani F, Joye I, Kachnic L, Maingon P, Marijnen C, Ngan S, Haustermans K.
   International consensus guidelines on Clinical Target Volume delineation in rectal cancer. Radiother Oncol. 2016 Aug;120(2):195-201.
3. Sacher F, Gandjbakhch E, Maury P, Jenny C, Khalifa J, Boveda S, Defaye P, Gras D, Klug D, Laurent G, Lellouche N, Mansourati J, Marijon E, Piot O, Taieb J, Cochet H, Maingon P, Pruvot E, Fauchier L; Working Group of Cardiac Pacing,
   Electrophysiology of the French Society of Cardiology. Focus on stereotactic radiotherapy: A new way to treat severe ventricular arrhythmias? Arch Cardiovasc Dis. 2021 Feb;114(2):140-149.
4. Malicki J, Bly R, Bulot M, Godet JL, Jahnen A, Krengli M, Maingon P, Prieto Martin C, Skrobala A, Valero M, Jarvinen H.
   Patient safety in external beam radiotherapy, results of the ACCIRAD project: Recommendations for radiotherapy institutions and national authorities on assessing risks and analysing adverse error-events and near misses. Radiother Oncol. 2018 May;127(2):164-170
5. Pasquier D, Nickers P, Peiffert D, Maingon P, Pommier P, Lacornerie T, Tresch E, Barthoulot M, Lartigau E.
   A Multicenter Phase 2 Study of Ultrahypofractionated Stereotactic Boost After External Beam Radiotherapy in Intermediate-risk Prostate Carcinoma: A Very Long-term Analysis of the CKNO-PRO Trial. Eur Urol Open Sci. 2023 Jul 4;54:80-87.

Abdelkrim MANNIOUI

FACULTE DES SCIENCES ET INGENIERIE

Ingénieur de Recherche, Sorbonne université,

Responsable de l’animalerie Aquatique de l’Institut de Biologie Paris-Seine (IBPS)

MISSIONS

Responsables de stage:

MODULE SPÉCIFIQUE  « ESPÈCES AQUATIQUES » POUR LES CONCEPTEURS DE PROJETS EXPÉRIMENTAUX UTILISANT DES ANIMAUX VIVANTS (FORMATION RÉGLEMENTAIRE) : Formation spécifique niveau 1, modèles aquatiques

Intervention dans le stage :

Bien-être des animaux aquatiques

Techniques maîtrisées :

Zootechnie et édition de génome chez les animaux aquatiques (Poissons et Amphibiens)

Expérimentation animale

Biologie moléculaire, Biologie cellulaire, Bioinformatique

DERNIERES PUBLICATIONS

1. A retroviral link to vertebrate myelination through retrotransposon-RNA-mediated control of myelin gene expression. Ghosh T, Almeida RG, Zhao C, Mannioui A, Martin E, Fleet A, Chen CZ, Assinck P, Ellams S, Gonzalez GA, Graham SC, Rowitch DH, Stott K, Adams I, Zalc B, Goldman N, Lyons DA, Franklin RJM. Cell. 2024 Feb 15;187(4):814-830.e23.
2. Monitoring recovery after CNS demyelination, a novel tool to de-risk pro-remyelinating strategies. Henriet E, Martin EM, Jubin P, Langui D, Mannioui A, Stankoff B, Lubetzki C, Khakhalin A, Zalc B.Brain. 2023 Jun 1;146(6):2453-2463.
3. Immunoblot-based assays for assessing autophagy in the turquoise killifish Nothobranchius furzeri. Anagnostopoulos G, Montégut L, Chen H, Carbonnier V, Martins I, Mangane K, Mannioui A, Bois A, Baracco EE, Maiuri MC, Kroemer G.Methods Cell Biol. 2021;165:123-138.
4. Physical models of infant mortality: implications for defects in biological systems. Bois A, García-Roger EM, Hong E, Hutzler S, Irannezhad A, Mannioui A, Richmond P, Roehner BM, Tronche S.J Biol Phys. 2020 Dec;46(4):371-394.

Brevet :

Animal Feed Dispenser | CANDELIER Raphael, MANNIOUI Abdelkrim et al. (Europe et extension aux Etats-Unis).

US2021000070A1         ANIMAL FEED DISPENSER      2021-01-07

EP3758476A1                ANIMAL FEED DISPENSER      2021-01-06

WO2019166115A1       ANIMAL FEED DISPENSER      2019-09-06

Responsable pédagogique du Master Sociologie : Chargé(e) d’études sociologiques Conseil, enquêtes, évaluation à la Faculté des Lettres de Sorbonne Université.

Responsable pédagogique de la licence « MASTER LLCER Études germaniques : Médiation interculturelle et traduction dans l’Espace Germanique et Nordique (MEGEN) » à la Faculté des Lettres de Sorbonne Université.

Missions

Martin Dres est Professeur des Universités à la Faculté de Santé Sorbonne Université et Praticien Hospitalier dans le Service de Médecine intensive Réanimation – SRPR (EOLE) de l’hôpital de la Pitié-Salpêtrière. Son équipe développe depuis plusieurs années un axe de recherche et d’expertise consacré à la séparation du ventilateur des patients de soins critiques. En particulier, les thématiques abordées sont:

1. Évaluation de la fonction des muscles respiratoires
2. Stimulation phrénique diagnostique et thérapeutique
3. Modalités du sevrage de la ventilation

Références

1. Dres M, Gama de Abreu M, Merdji H, Müller-Redetzky H, Dellweg D, Randerath WJ, Mortaza S, Jung B, Bruells C, Mörer O, Scharffenberg M, Jaber S, Besset S, Bitter T, Geise A, Heine A, Malfertheiner MV, Kortgen A, Benzaquen J, Nelson T, Uhrig A, Mönig O, Meziani F, Demoule A, Similowski T; RESCUE-2 Study Group Investigators. Randomised Clinical Study of Temporary Transvenous Phrenic Nerve Stimulation in Difficult-to-Wean Patients. Am J Respir Crit Care Med. 2022 ;205(10):1169-1178.
2. Dres M, Similowski T, Goligher EC, Pham T, Sergenyuk L, Telias I, Grieco DL, Ouechani W, Junhasavasdikul D, Sklar MC, Damiani LF, Melo L, Santis C, Degravi L, Decavèle M, Brochard L, Demoule A. Dyspnea and respiratory muscles ultrasound to predict extubation failure. Eur Respir J. 2021 58(5):2100002.
3. Dres M, Younes M, Rittayamai N, Kendzerska T, Telias I, Grieco DL, Pham T, Junhasavasdikul D, Chau E, Mehta S, Wilcox ME, Leung R, Drouot X, Brochard L. Sleep and Pathological Wakefulness at Time of Liberation from Mechanical Ventilation (SLEEWE): A Prospective Multicenter Physiological Study. Am J Respir Crit Care Med. 2019 ;199 :1106-1115.
4. Dres M, Goligher EC, Heunks LMA, Brochard LJ. Critical illness-associated diaphragm weakness. Intensive Care Med. 2017 Oct;43(10):1441-1452.
5. Dres M, Dubé B-P, Mayaux J, Delemazure J, Reuter D, Brochard L, Similowski T, Demoule T. Coexistence and impact of limb muscle and diaphragm weakness at time of liberation from mechanical ventilation in medical ICU patients. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 2017; 195:57-66.

Judith Matharan soutient depuis plus de 20 ans les transformations des organisations et des individus qui les composent en s’attachant à faire circuler la parole et stimuler la réflexion. Nourrie de sciences sociales et experte en communication, elle accompagne aujourd’hui celles et ceux qui veulent gagner en confiance et en présence à l’oral, rendre leur discours plus vivant et engageant ou encore structurer un message qui marque et qui reste. Son approche est attentive, pragmatique et joyeuse.